Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms