Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PMS2P11Q13670 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms