Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DNASE1L3Q13609 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms