Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF5Q13243 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms