Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COX10Q12887 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COX10Q12887 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms