Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
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