Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms