Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms