Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms