Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
OC90Q02509 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
OC90Q02509 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
OC90Q02509 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 654.3 ms