Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MC1RQ01726 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms