Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms