Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP4P49662 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP4P49662 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms