Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFMP43652 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AFMP43652 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AFMP43652 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AFMP43652 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AFMP43652 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AFMP43652 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AFMP43652 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AFMP43652 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AFMP43652 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AFMP43652 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AFMP43652 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AFMP43652 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms