Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFI27P40305 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFI27P40305 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFI27P40305 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFI27P40305 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFI27P40305 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFI27P40305 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IFI27P40305 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms