Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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