Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPS6KB1P23443 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms