Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AMY2BP19961 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AMY2BP19961 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms