Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM21P19474 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms