Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTLA4P16410 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTLA4P16410 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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