Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms