Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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