Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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