Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms