Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRAMEF22A3QJZ6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.4 ms