Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms