Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms