Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTNNAL1Q9UBT7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms