Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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