Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL2Q99962 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms