Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP47Q96K76 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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USP47Q96K76 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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USP47Q96K76 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP47Q96K76 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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USP47Q96K76 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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USP47Q96K76 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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USP47Q96K76 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP47Q96K76 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP47Q96K76 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP47Q96K76 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP47Q96K76 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP47Q96K76 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP47Q96K76 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP47Q96K76 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
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