Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms