Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTP4Q96DX8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms