Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAVIN3Q969G5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms