Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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