Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms