Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms