Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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