Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYTH1Q15438 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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