Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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DDX39BQ13838 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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DDX39BQ13838 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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DDX39BQ13838 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DDX39BQ13838 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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