Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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