Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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KCNH2Q12809 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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KCNH2Q12809 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNH2Q12809 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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