Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms