Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD51Q06609 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179 ms