Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CENPEQ02224 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms