Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms