Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113P63132 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113P63132 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63132 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms