Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL23P55773 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL23P55773 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL23P55773 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL23P55773 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL23P55773 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL23P55773 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms