Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GJC1P36383 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GJC1P36383 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms