Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASQ1P31415 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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